Identifikasi cendawan endofit asal daun Pegagan (Centella asiatica) berdasarkan morfologi dan penanda molekuler daerah ITS (Internal Transcribed Spacer)

Abstract

Tanaman Pegagan (Centella asiatica) ialah tanaman tropis yang banyak terdapat di Indonesia dan dimanfaatkan sebagai tanaman obat karena khasiat dari kandungan bioaktifnya. Dalam hidupnya pegagan berasosiasi dengan cendawan endofit, yang bersifat simbiosis mutualistik atau netral. Senyawa bioaktif yang dikandung pegagan dapat dihasilkan oleh cendawan endofit atau hasil dari interaksi antara tanaman pegagan dengan cendawan endofit yang bersimbiosis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman cendawan endofit asal daun tanaman pegagan secara morfologi dan molekuler menggunakan daerah ITS. Tujuh Isolat cendawan yang berasal dari penelitian sebelumnya kemudian diidentifikasi pada penelitian ini. Identifikasi morfologi meliputi pengamatan koloni, struktur mikroskopis dari hifa dan spora. Identifikasi molekular dilakukan dengan terlebih dahulu mengisolasi DNA genom dengan menggunakan metode CTAB (Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide) yang telah dimodifikasi. DNA hasil isolasi kemudian diamplifikasi pada daerah ITS 1 dan ITS 2 termasuk juga daerah 5.8 dengan ITSI dan ITS 4 sebagai pasangan primer. Hasil amplifikasi kemudian diurutkan susunan basanya, dan dianalisis dengan menggunakan program BLASTN. Berdasarkan hasil identifikasi secara morfologi diketahui bahwa ketujuh isolat tersebut teridentifikasi kedalam 5 genus yaitu Aspergilus, Colletotrichum, Fusarium, Mycoleptodiscus, dan Phoma. Berdasarkan hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa kesemua isolat cendawan termasuk filum Ascomycota dan mempunyai nilai homologi kemiripan dengan data yang ada pada Gene Bank berkisar antara 81% sampai 99%. Ke 7 cendawan tersebut ialah Aspergillus sydowii, Colletotrichum gloeosporiorides, dua isolat Fusarium solani, dua isolat Mycoleptodiscus indicus dan Phoma sp.