| dc.description.abstract | Ayam kampung merupakan salah satu ayam lokal Indonesia yang telah
terkenal dengan kelezatan dan ketahanannya terhadap penyakit, terutama tahan
terhadap Salmonella. Salah satu penciri genetik ketahanan ayam pada bakteri ini
adalah gen Toll-like Receptor 4 (TLR4). TLR4 (toll-like receptor 4) merupakan
gen pengkode protein TLR4 yang mengontrol sinyal imun non spesifik sebagai
pertahanan pertama terhadap serangan bakteri S. entiritidis. Tujuan penelitian ini
adalah mengidentifikasi keragaman gen TLR4 pada ayam lokal Indonesia dan
persilangannya (kampung, broiler, KB, KBKB, BK, kapas, sentul, dan
merawang). Gen TLR4 berhasil digenotyping pada 214 ayam dengan teknik
PIRA-PCR. Genotyping dilakukan pada exon 2 dengan panjang produk 220 bp.
Enzim restriksi MscI memotong produk PCR dengan panjang fragmen 196 bp dan
24 bp, diperoleh dua alel (G dan A), dan tiga genotipe (GG, AG, dan AA). Hasil
penelitian menunjukkan bahwa ayam KBKB, KB, kampung, merawang, dan
sentul bersifat polimorfik (0.05-0.33). Ayam broiler, BK, dan kapas bersifat
monomorfik. Keragaman tertinggi ditunjukkan oleh rumpun ayam lokal yaitu
kampung, merawang, dan sentul. Nilai PIC tertinggi berada pada ayam lokal
(ayam kampung) dengan kategori sedang (0.40).
Kata kunci : ayam lokal, genotyping, keragaman, TLR4 | id |
