Identifikasi Spesies Fabavirus Penyebab Penyakit Mosaik pada Tanaman Nilam

Abstract

Survei di daerah Jawa Barat dilakukan untuk mendeteksi infeksi Fabavirus pada tanaman nilam (Pogostemon cablin Benth) dan untuk mengidentifikasi spesies virus berdasarkan sikuen nukleotidanya. Dari 25 sampel tanaman nilam yang menunjukkan gejala mosaik dan variasinya, dua sampel didapatkan dari Cicurug, Sukabumi dan dua lainnya berasal dari Gunun Bunder, Bogor positif diinfeksi oleh Fabavirus (dibuat dengan nama CG15 dan CG16 & GB27 dan GB29, berturut-turut) berdasarkan enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) menggunakan antiserum untuk Fabavirus. Keberadaan infeksi Fabavirus pada sampel tanaman nilam dikonfirmasi dengan uji molekuler melalui reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) menggunakan primer untuk Fabavirus. Untuk menguraikan spesies dari isolat virus, produk RT-PCR CG16 dan GB29 disikuensing langsung tanpa kloning pada vektor plasmid. Sikuen terdiri dari sekitar 322 nukleotida, berdasarkan primer yang didesain [BBWVVSSP (5'-GTBTCDAGTGCTYTDGAAGG-3', B = C, G, or T; D = A, G, or T; Y = C ог T) and BBWVKMRM (5'- TDGWDCCATCVAGICKCATTTT-3', W = A or T; V = A, C, or G; I = Inosine; KG or T)]. Penjajaran sikuen nukleotida mengonfirmasi identitas dari isolat virus sebagai Broad bean wilt virus 2 (BBWV-2). Penelitian ini merupakan laporan pertama keberadaan BBWV-2 penyebab penyakit mosak pada tanaman nilam di Indonesia. Kata kunci: Nilam, Broad bean wilt virus 2.