Keragaman DNA mikrosatelit lokus HEL9 ILSTS6 dan INRA35 pada Sapi Bali di Pulau Bali dan Nusa Penida

Abstract

Sapi bali (Bos javanicus) adalah salah satu bangsa sapi asal Indonesia yang merupakan domestikasi dari banteng. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman DNA mikrosatelit pada sapi bali yang berada di Pulau Bali dan Nusa Penida dengan menggunakan lokus (HEL9, ILSTS6, dan INRA35). Sampel yang digunakan sebanyak 95 sampel DNA sapi bali yang diambil dari 48 ekor sapi bali di pulau Bali dan 47 ekor sapi bali di pulau Nusa Penida. Tiga penciri mikrosatelit (HEL9, ILSTS6 dan INRA35) digunakan untuk mengidentifikasi keragaman sapi bali. PCR menggunakan aplikasiGenAlex versi 6.501. Data yang dianalisis berupa jumlah alel (na), alel efektif (ne), frekuensi alel, heterosigositas observasi (Ho), heterosigositas harapan (He), polymorphism information content (PIC), dan uji Amova. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rata-rata heterosigositas pada sapi bali yang ada di Pulau Bali lebih tinggi dibandingkan Nusa Penida. Jumlah PIC sapi bali berkisar 0.190-0.666. Ketiga lokus yang diuji terhadap sapi bali di pulau Bali dan Nusa Penida berbeda dari marker, frekuensi alel dan tingkat kekerabatan dengan nilai keragaman sebesar 9%...