Karakterisasi gen penyandi resistensi antibiotika dari Escherichia coli yang diisolasidari mulut Varanus spp.

Abstract

Escherichia coli yang diisolasi dari mulut Varanus spp. mempunyai sifat resisten terhadap ampisilin. Gen penyandi resistensi terhadap antibiotika biasa ditemukan pada plasmid, transposon, dan integron. Karakterisasi gen penyandi resistensi terhadap antibiotika dilakukan dengan pemotongan plasmid menggunakan enzim restriksi dan deteksi integron dengan Polymerase Chain Reaction (PCR). Pada penelitian ini, dengan melakukan subkloning, ukuran fragmen DNA penyandi resistensi ampisilin sebesar 15 kb yang diperoleh dari E. coll asal Varanus spp. dan diklon pada pAS901 (Yogiara, 1998) berhasil diperkecil menjadi 6,2 kb. Hasil deteksi integron dengan PCR pada 9 isolat E. coli menunjukkan bahwa ada 8 isolat diantaranya mengandung daerah konservatif dari integron. Satu isolat yang tidak mengandung integron yaitu pEP10 (turunan PAS901 yang sudah diperkecil menjadi 13,8 kb). Hal ini mungkin disebabkan karena ada bagian- bagian tertentu dari integron yang terpotong saat memperkecil ukuran plasmid. Isolat yang mengandung sisipan potongan DNA penyandi resistensi terhadap antibiotika pada integron, hanya diperoleh dari isolat SG2 dengan ukuran 1 kb. Potongan DNA tersebut adalah gen penyandi resistensi terhadap spektinomisin dan streptomisin.