Verifikasi cacing Lumbricus rubellus Hoffmeister, 1843 dan Pheretima sp. di peternakan berdasarkan morfologi dan barcode DNA menggunakan gen cytochrome oxidase I

Abstract

Usaha domestikasi dan budidaya cacing tanah telah memberikan keuntungan yang cukup tinggi sehingga budidaya cacing tanah marak dilakukan. Pembudidayaan dilakukan oleh banyak peternak tanpa ada validasi taksonomi spesies cacing yang dibiakkan. Penelitian dilakukan terhadap cacing yang disebut Lumbricus rubellus pada peternakan Pengalengan dan Pheretima sp. di peternakan Kampus IPB Dramaga. Cacing diidentifikasi kembali berdasarkan karakter morfologi dan gen COI dengan mengekstraksi DNA mitokondria. Hasil verifikasi morfologi menunjukkan bahwa cacing yang disebut sebagai L. rubellus pada peternakan Pengalengan adalah Eisenia andrei sedangkan yang disebut Pheretima sp. pada peternakan Kampus IPB adalah Eudrilus eugeniae. Hasil BLAST dan penyejajaran sekuen DNA Gen COI parsial menegaskan hasil identifikasi morfologi. Berdasarkan data nukleotida COI parsial didapatkan bahwa Eisenia andrei dari Pengalengan memiliki jarak genetik 0,0% terhadap Ei. andrei dan 23,4% terhadap L. rubellus pada GenBank. Eu. eugeniae dari Peternakan IPB memiliki jarak genetik 0,3% dengan Eu. eugeniae yang berada di BOLD System.