Karakterisasi Ekson dan Intron 7, 8, 9 Gen Endo-β-1,4-glukanase pada Rayap Coptotermes curvignathus

Abstract

Rayap mampu mendegradasi selulosa karena adanya endo-β-1,4-glukanase rayap. Rayap Coptotermes curvignathus adalah spesies rayap yang banyak ditemukan di Indonesia. Rayap ini merupakan hama penting dengan kemampuan mencerna kayu yang tinggi. Gen endo-β-1,4-glukanase rayap C. curvignathus (CcEG) belum memiliki data genomik lengkap. Dengan demikian, penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi ekson dan intron 7, 8, 9 gen endo-β-1,4-glukanase pada rayap C. curvignathus (CcEG). Ekstraksi DNA menggunakan metode CTAB yang dimodifikasi. Alignment nukleotida dan asam amino dilakukan antara endo-β-1,4-glukanase rayap C. curvignathus (CcEG) hasil penelitian ini dengan endo-β-1,4-glukanase rayap C. formosanus (CfEG) dan Nasutitermes takagoensis (NtEG). Ekson 7, 8, 9 dan intron 7, 8 CcEG masing-masing berukuran 165, 140, 214, 503 dan 546 pb. Ekson 7, 8, dan 9 CcEG panjangnya sama dengan ekson yang sama pada gen endo-β-1,4-glukanase rayap C. formosanus (CfEG) dan homolog 99%. Hasil deduksi ekson 7, 8, 9 CcEG sebanyak 172 asam amino putative dan masuk dalam kelompok Glycosyl Hydrolase Family 9 (GHF 9). Intron 7 dan 8 CcEG berbeda panjang dan posisi dengan intron 8, 9 gen endo-β-1,4-glukanase rayap Nasutitermes takasagoensis (NtEG). Hasil penelitian ini dapat menjadi dasar untuk penelitian mengenai karakterisasi enzim selulase rayap C. curvignathus.