Penapisan Virtual Interaksi Senyawa Fenolik dan Amin Biogenis dengan Reseptor Dopamin D2 secara In Silico

Abstract

Prolaktin berperan penting dalam sekresi Air Susu Ibu (ASI). Dalam kemampuannya sebagai antagonis prolaktin, dopamin akan terikat pada reseptornya (D2; dikenal dengan identitas 1I15 dalam Protein Data Bank) dan menekan sekresi prolaktin dari kelenjar pituitari. Ligan yang dapat berinteraksi dengan reseptor D2 diperlukan sehingga dopamin tidak dapat terikat lagi dengan reseptornya.Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa ligan dalam tumbuhan yang dapat berinteraksi dengan reseptor dopamin D2 melalui mekanismenya dan menghasilkan data energi ikatan ligan dengan makromolekul (energy bebas Gibbs; ΔG). Selain itu, untuk membuat hipotesis interaksi yang dapat terjadi antara ligan dengan reseptor dopamin D2.Ligan-ligan yang diujikan berasal dari tumbuhan yang secara pengalaman empiris telah terbukti dapat meningkatkan volume ASI, juga berasal dari senyawa lain dalam satu kelompok fenolik yang belum teruji secara pengalaman empiris. Ligan-ligan ini secara alami terdapat dalam tumbuhan yang lazim dikonsumsi. Penapisan virtual dilakukan dengan menggunakan ligan yang ditambatkan pada makromolekul reseptor dopamin D2 kemudian diobservasi nilai energi ikatan yang terbentuk. Program yang digunakan adalah AutoDock 4.2 berbantu PyRx 0.8 untuk penapisan virtual, sedangkan untuk visualisasi posisi penambatan digunakan program bantuan AutoDock Tools 1.5.6rc3, program PyMOL 1.3 (visualisasi tiga dimensi) dan Ligplot+ 1.4.4 (visualisasi dua dimensi) untuk melihat interaksi yang terjadi. Ligan-ligan yang diujikan antara lain ligan kontrol (dopamin, loxapin dan domperidon) dan ligan sampel asam kafeat, asam klorogenat, asam ferulat (sub kelas asam hidroksi sinamat), sesamin, secoisolariciresinol, pinoresinol, syringaresinol, lariciresinol, matairesinol (sub kelas lignan), kaempferol, quersetin, mirisetin (sub kelas flavonol), apigenin, luteolin (sub kelas flavon), naringenin, hesperitin (sub kelas flavanon), catechin, gallocatechin (sub kelas flavanol), pelargonidin, cyanidin, malvidin (sub kelas anthocyanidin), prodelphinidin (sub kelas tannin terkondensasi atau proanthocyanidin), daidzein, genistein, glycitein (sub kelas isoflavon), putrescin, cadaverin, histamin, tyramin, spermidin, spermin (biogenik amin), serta carvacrol, thymol (monoterpen fenol). Senyawa fenolik dan biogenik amindalam tumbuhan yang lazim dikonsumsi di Indonesia berpotensi sebagai ligan yang dapat berinteraksi dengan makromolekul reseptor dopaminD2.Nilai energi ikatan ligan (ΔG) tertinggi dan terendah secara berurutan dimiliki oleh sesamin dan spermin (-7,25; -3,47 kkal/mol). Ikatan hidrogen lebih sering terjadi pada residu THR 84, PHE 119, ASN 192, PRO 204, dan SER 209. Sedangkan interaksi hidrofobik lebih sering melibatkan residu TRP 182 dan HIS 189.Hasil in silico ini sangat bermanfaat dalam memberikan gambaran mengenai mekanisme interaksi yang terjadi dan sebagai “jembatan” menuju tahapan analisis selanjutnya baik secara in vitro maupun in vivo.