Analisis Keragaman Genetik Jati Asal Sulawesi Selatan Berdasarkan Marker SSR.

Abstract

Hasil penelitian menunjukkan bahwa total alel yang terdeteksi pada lima lokus SSR ada 19 alel, jumlah alel tiap lokus minimum 2 alel dan maksimum 5 alel dengan rata-rata 3.8 per lokus. Nilai Polimorphic Information Content (PIC) tertinggi pada lokus ATC02 (0.70) dengan rata-rata 0.52. Rata-rata keragaman genetik tertinggi pada populasi pohon asal Massepe (0.663) untuk semua lokus, kemudian populasi pohon asal Ceddie dan populasi bibit asal Massepe. Nilai indeks fiksasi dalam populasi menunjukkan ekses heterosigositas kecuali pada populasi bibit asal Massepe terjadi defisit heterosigositas yang ditunjukkan dengan nilai Fis yang positif. Lokus AGT10 nyata menyimpang dari hukum Hardy-Weinberg untuk semua populasi yang dianalisis. Koefisien diferensiasi genetik relatif rendah (Gst = 0.022) atau sekitar 2.2 % variasi SSR diantara populasi. Analisis AMOV A menunjukkan komponen dan persentase ragam terbesar terdapat di dalam populasi baik populasi pohon maupun populasi bibit, dibanding antar populasi dalam grup dan antar grup itu sendiri. Persentase ragam untuk populasi pohon dan bibit adalah 93.75 % dan 92.74%. Analisis pengelompokan individu untuk semua populasi dengan metode UPGMA, menunjukkan lima kelompok utama pada koefisien jarak genetik 0.50. lndividu dari empat lokasi mengelompok secara acak dengan jarak genetik yang bervariasi. Penyebaran biji tanaman jati asal Sulawesi Selatan tidak cenderung selalu berdekatan dengan tetuanya.