Validasi Susunan Basa Nukleotida Gen COI pada Ikan Gabus (Channa striata Bloch, 1793) di Perairan Bekasi dan Bogor, Jawa Barat

Abstract

Ikan gabus (Channa striata) merupakan ikan potensial sebagai ikan konsumsi yang produksinya masih bergantung pada tangkapan alam. Adanya alih fungsi lahan di daerah Bekasi dan Bogor, menyebabkan berkurangnya jumlah habitat dari ikan gabus. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi karakteristik molekular ikan gabus meliputi similaritas, jarak genetik, dan kekerabatan pohon filogeni. Penelitian dilakukan terhadap ikan gabus yang berasal dari dua populasi berbeda yang dikumpulkan dari Pondok Soga, Babelan, Bekasi dan Situ Citatah, Bogor. Informasi genetik didapatkan melalui metode DNA barcoding dengan parsial sekuen gen COI. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa ikan gabus yang berasal dari perairan Bekasi dan Bogor merupakan spesies Channa striata. Analisis jarak genetik menunjukkan bahwa spesies Channa striata Bekasi dan Channa striata Bogor memiliki jarak genetik yang sangat dekat. Analisis filogeni menunjukkan adanya kelompok monofiletik, polifiletik, dan parafiletik yang terbentuk. Nilai keragaman haplotipe tinggi terdapat pada sampel Bogor, dan nilai keragaman haplotipe yang rendah terdapat pada sampel Bekasi. Kajian identifikasi molekular dengan marka gen lainnya, pengembangan budidaya, serta analisis geografis perlu dilakukan sebagai upaya pengelolaan terhadap ikan gabus.