Karakteristik Komponen Aktif dan Penyusunan Draft Genom Referensi Ulva lactuca Perairan Aceh Secara De Novo

Abstract

Rumput laut hijau Ulva lactuca mengandung senyawa bioaktif yang berperan sebagai antioksidan alami. Penelitian ini bertujuan menentukan karakteristik komponen aktif U. lactuca yang berasal dari Perairan Aceh, menyusun draft genom referensi secara de novo, dan mengidentifikasi keberadaan gen antioksidan enzimatik dan non enzimatik. Penelitian ini terdiri dari preparasi sampel dan analisis komponen aktif secara in vitro dan de novo. In vitro meliputi analisis fitokimia, total fenol, aktivitas dan kapasitas antioksidan ekstrak U. lactuca penambahan etanol pada perbandingan 1:5. De novo meliputi isolasi DNA menggunakan CTAB dan Geneaid, uji kuantitas dan kualitas DNA, sequencing DNA, analisis bioinformatika, dan filogenetik. Ekstrak U. lactuca menghasilkan rendemen 14% yang mengandung senyawa aktif alkaloid, flavonoid, tanin, fenol hidrokuinon, dan steroid, memiliki kadar total fenol sebesar 222,90 ± 1,92 mg GAE/g ekstrak, aktivitas antioksidan tinggi dengan kapasitas antioksidan sebesar 39,30 ± 2,876 μmol trolox/g ekstrak. Berdasarkan analisis genom kloroplas sampel B4 teridentifikasi sebagai spesies U. lactuca, serta dihasilkan peta genom kloroplasnya. Gen pengkode aktivitas antioksidan enzimatik Superoxide Dismutase (SOD), Catalase (CAT), Peroxiredoxin (PRX), Glutathione S-transferase (GST), Heme Oxygenase (HO), serta non enzimatik auksin, karotenoid, flavonoid, tokoferol, uric acid juga berhasil diidentifikasi secara bioinformatik.