Hubungan Kekerabatan Genus Pteris (Pteridaceae) Berdasarkan Sekuen Gen rbcl dan matK

Abstract

Kajian ilmu evolusi pada masa modern saat ini dapat dijelaskan dalam beberapa aspek termasuk evolusi molekuler yang dapat menjelaskan hubungan kekerabatan antar satu spesies dengan spesies lain. Pteris merupakan marga tumbuhan paku yang sangat beranekaragam sehingga menarik untuk dipelajari hubungan kekerabatannya. Penelitian ini bertujuan mengetahui hubungan kekerabatan spesies Pteris berdasarkan sekuen gen rbcL dan matK. Metode penelitian meliputi seleksi sekuen taksa untuk gen rbcL dan matK pada genus Pteris dari genebank National Center for Biotechnology Information (NCBI), pensejajaran sekuen, dan analisis data. Sekuen gen rbcL dan matK diunduh kemudian dilakukan pensejajaran dengan aplikasi Unipro UGENE dan selanjutnya dilakukan konstruksi pohon filogeni dengan aplikasi Phylogeny Analysis Using Parsimony (PAUP). Konstruksi kladogram menggunakan metode maximum parsimony sedangkan konstruksi fenogram menggunakan metode Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Average (UPGMA). Hasil konstruksi kladogram dan fenogram menunjukkan keselarasan pola percabangan yang membentuk dua klada utama (ingrup) serta satu klada outgroup. Pola percabangan (topologi) pada ingroup fenogram dan kladogram masing-masing gen memiliki keselarasan.