Hubungan Kekerabatan Genus Pteris (Pteridaceae) Berdasarkan Sekuen Gen rbcl dan matK
Date
2022Author
Hafidhullah, Nazala
Djuita, Nina Ratna
Chikmawati, Tatik
Metadata
Show full item recordAbstract
Kajian ilmu evolusi pada masa modern saat ini dapat dijelaskan dalam
beberapa aspek termasuk evolusi molekuler yang dapat menjelaskan hubungan
kekerabatan antar satu spesies dengan spesies lain. Pteris merupakan marga
tumbuhan paku yang sangat beranekaragam sehingga menarik untuk dipelajari
hubungan kekerabatannya. Penelitian ini bertujuan mengetahui hubungan
kekerabatan spesies Pteris berdasarkan sekuen gen rbcL dan matK. Metode
penelitian meliputi seleksi sekuen taksa untuk gen rbcL dan matK pada genus Pteris
dari genebank National Center for Biotechnology Information (NCBI),
pensejajaran sekuen, dan analisis data. Sekuen gen rbcL dan matK diunduh
kemudian dilakukan pensejajaran dengan aplikasi Unipro UGENE dan selanjutnya
dilakukan konstruksi pohon filogeni dengan aplikasi Phylogeny Analysis Using
Parsimony (PAUP). Konstruksi kladogram menggunakan metode maximum
parsimony sedangkan konstruksi fenogram menggunakan metode Unweighted Pair
Group Method with Arithmetic Average (UPGMA). Hasil konstruksi kladogram
dan fenogram menunjukkan keselarasan pola percabangan yang membentuk dua
klada utama (ingrup) serta satu klada outgroup. Pola percabangan (topologi) pada
ingroup fenogram dan kladogram masing-masing gen memiliki keselarasan.
Collections
- UT - Biology [2145]