Identifikasi Strain Spodoptera frugiperda di Indonesia dengan Pendekatan Molekuler COI (Cytochrome c Oxidase Subunit I) dan Tpi (Triosephosphate isomerase).

Abstract

Ulat grayak jagung, Spodoptera frugiperda (JE Smith) (Lepidoptera: Noctuidae), dapat menyebabkan kerusakan parah pada jagung, padi, dan 80 spesies tanaman lainnya. Hama ini menyerang semua stadia pertumbuhan tanaman sehingga menyebabkan kegagalan produksi. Gejala awal dari serangan hama ini ialah adanya bekas gerekan larva dan serbuk kasar menyerupai serbuk gergaji pada permukaan atas daun atau di sekitar pucuk tanaman. Spodoptera frugiperda adalah hama invasif yang mampu beradaptasi dengan baik dan mampu terbang jauh. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui strain S. frugiperda dari beberapa wilayah di Indonesia dengan pendekatan molekuler, yaitu dengan analisis gen COI (Cytochrome c Oxidase Subunit I) dan Tpi (Triosephosphate isomerase). Sampel serangga yang digunakan dalam penelitian ini diambil dari beberapa wilayah di Indonesia seperti Kota Padang, Jambi, Bogor, Pinrang, Purwokerto, Tegal, Pontianak, dan Kabupaten Morotai. Analisis homologi gen COIA, COIB dan Tpi dilakukan dengan menggunakan aplikasi BLAST pada program NCBI (National Center for Biotechnology Information), sedangkan analisis filogenetik dilakukan dengan menggunakan aplikasi Mega X. Spodoptera frugiperda dari beberapa kota Jambi, Bogor, Pinrang, Purwokerto, Tegal, Pontianak, dan Kabupaten Morotai merupakan strain R (R-strain) dan dari Kota Padang merupakan strain C (C-strain) menurut analisis gen COIA. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa Spodoptera frugiperda dari kota Jambi, Bogor, Pinrang, Purwokerto, Tegal, Pontianak, dan Kabupaten Morotai berkerabat dekat dengan S. frugiperda asal China, Nepal, Florida dan Prancis. Berdasarkan hasil analisis gen COIB dari seluruh lokasi mendapatkan hasil R-strain. Hasil analisis gen Tpi dari beberapa lokasi mendapatkan C-strain. Penelitian identifikasi strain berguna dalam menentukan strategi pengendalian S. frugiperda