Keragaman Genetik Tiliqua Scincoides (Squmata:Scincidae) berdasarkan Gen COI DNA Mitokondria

Abstract

Kadal lidah biru (Scincidae: Tiliqua: Tiliqua scincoides) merupakan kadal diurnal, soliter, omnivora dan memiliki lidah berwarna biru. Distribusi alami kadal lidah biru terdapat di wilayah Indonesia bagian Timur, Australia dan Papua Nugini. Studi keragaman genetik dilakukan untuk mengetahui besarnya variasi genetik sebagai kunci konservasi dan pemanfaatannya. Ruas gen yang diamati adalah sekuen COI dari DNA mitokondria. Sampel buccal cells dijadikan sebagai sumber molekul DNA. Amplifikasi PCR sekuen COI genom mitokondria dengan primer AF645F dan AF646R kemudian runutan nukleotidanya disekuensing. Sekuen DNA gen COI hasil penyejajaran adalah 741 pasang basa yang terkonfirmasi sebagai spesies Tiliqua scincoides. Enam belas haplotipe berhasil teridentifikasi dari 93 situs polimorfik. Visualisasi haplotipe network yang terbentuk menjadi 16 haplotipe dengan 2 haplogroup yang dapat membedakan antar lokasi sampel. Jarak genetik menunjukkan kisaran antara 0.000-0.114. Nilai keragaman nukleotida (π) sebesar 0.052±0,007 dan keragaman haplotipe (hd) sebesar 0.971±0.027 menggambarkan keragaman genetik yang tinggi. Analisis pohon filogeografi membentuk 2 clade utama yang membedakan antar lokasi pada sampel kadal lidah biru.