Telaah Interaksi Bestatin dan Aminopeptidase N3 pada Toxoplasma gondii secara In Silico
Abstract
Toxoplasma gondii telah menginfeksi sebanyak 30% populasi mamalia di
dunia. Parasit ini jika menginfeksi wanita hamil dapat menimbulkan kebutaan,
retardasi mental, bahkan kematian pada janin. Di Amerika selatan ditemukan isolat
tipe baru T. gondii yang resistan terhadap berbagai macam obat anti-T. gondii. T.
gondii Aminopeptidase N3 (TgAPN3) merupakan target potensial penambatan
molekul yang memilki spesifitas tertinggi pada asam amino alanin. Ligan 4
memiliki stabilitas ikatan lebih baik dibanding ligan 9 pada TgAPN3 karena adanya
ikatan koordinasi dengan ion zink yang berperan kuat dalam interaksi protein-ligan.
Ligan A10 merupakan kandidat obat anti-T. gondii terbaik dengan terminal C
mengandung elektron terkonjugasi, rantai siklik, dan non polar. Konfigurasi ligan
A10 terbaik diperoleh dengan adanya kesesuaian bagian hidrofobisitas dengan
TgAPN3 serta interaksi intramolekul antar rantai hidrofobik yang juga ditemukan
pada ligan A1, A4, dan A6. Toxoplasma gondii has infected 30% of the world's mammal population. If
this parasite infects pregnant women, can cause blindness, mental retardation, and
death in the fetus. In South America, isolates of a new type of T. gondii were found
that were resistant to various anti-T. gondii drugs. T. gondii Aminopeptidase N3
(TgAPN3) is a potential target for molecular docking that has the highest specificity
for the alanine amino acid. Ligand 4 has better bond stability than ligand 9 in
TgAPN3 because of the coordination bonds with zinc ions which play a strong role
in protein-ligand interactions. Ligand A10 is the best candidate for the anti-T.
gondii drug with a C terminal containing conjugated electrons, cyclic chain, and
non-polar. The best configuration of the ligand A10 was obtained by the suitability
of the hydrophobicity section with TgAPN3 and the intramolecular interactions
between hydrophobic chains which were also found in the ligands A1, A4, and A6.
Collections
- UT - Chemistry [2060]