Eksplorasi Rhizopodopsis javensis di Kebun Raya Cibodas: Verifikasi Posisi Taksonomi dan Analisis Variasi Infraspesiesnya

Abstract

Dahulu koleksi Rhizopodopsis hanya berupa herbarium dan kulturnya tidak tersedia. Upaya mengisolasi Rhizopodopsis pada substrat asalnya, buah Elaeagnus latifolia, dan buah lainnya yaitu Ficus variegata telah berhasil. Identifikasi kultur tersebut secara morfologi, dan molekuler menggunakan sekuens LSU dan EF-1α telah memastikan bahwa Rhizopodopsis berada dalam Rhizopodaceae (Mucorales). Namun, evaluasi kekerabatan Rhizopodaceae sering kali menggunakan ACT, selain LSU dan EF-1α serta kombinasinya. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menginventarisasi Rhizopodopsis asal buah di Kebun Raya Cibodas, memverifikasi kedudukannya dalam kelompok Rhizopus stolonifer dan menganalisis variasi infraspesiesnya berdasarkan karakter morfologi, dan molekuler. Kultur Mucorales hasil eksplorasi buah F. fistulosa, F. variegata, dan Lithocarpus indutus diidentifikasi secara morfologi. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa tiga dari lima kultur Mucorales yang diperoleh adalah R. javensis, sedangkan dua kultur lainnya adalah Rh. stolonifer. Hasil identifikasi morfologi didukung oleh hasil analisis filogenetik sekuens ACT, LSU, dan EF-1α menggunakan algoritme RAxML. Marka tunggal maupun kombinasinya menguatkan posisi Rhizopodopsis dalam kelompok Rh. stolonifer. Penggunaan marka ACT memberikan resolusi lebih baik daripada marka tunggal LSU dan EF-1α. Pada semua pohon, R. javensis terbagi dalam 2 sub-kelompok dengan nilai bootstrap yang tinggi. Dua karakter morfologi mendukung pengelompokan tersebut. Namun, untuk pengusulan varietas perlu dievaluasi dengan melibatkan lebih banyak spesimen.