Pemanfaatan Teknik End-Point PCR untuk Deteksi Bakteri Pengkode Gen Tyrosine Decarboxylase (TDC) pada Ikan Jenis Scombridae.

Abstract

Bakteri penghasil enzim Tyrosine decarboxylase (TDC) dapat dijumpai pada ikan yang telah mengalami kemunduran mutu. Enzim TDC dapat mengubah tirosin menjadi tiramin. Kandungan tiramin yang tinggi dapat menimbulkan efek toksik. Deteksi bakteri penghasil tiramin dapat dilakukan dengan metode molekuler menggunakan teknik PCR karena pengujiannya lebih cepat dan sensitif. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi gen TDC dan 16S rRNA berdasarkan urutan basa nukleotida melalui metode bioinformatika. Tahapan penelitian yang digunakan yaitu kultivasi bakteri, isolasi DNA bakteri menggunakan CTAB 2% dan kit isolasi DNA komersial, pengukuran kualitas dan konsentrasi DNA, amplifikasi DNA, sekuensing, dan identifikasi spesies. Isolat DNA bakteri yang berhasil didapatkan yaitu dari sampel hasil kultivasi. Sampel yang berhasil diamplifikasi oleh gen TDC adalah tuna hasil kultivasi (BE) menggunakan kit TIANamp Genomic DNA. Hasil amplifikasi diperoleh dengan berat molekul 825 pb dan teridentifikasi sebagai spesies Carnobacterium sp.