Penapisan Aktinomiset Rizosfer Penghasil Kitinase dan Penentuan Keragaman Genetiknya

Abstract

Komunitas mikroba tanah, khususnya kelompok aktinomiset rizosfer merupakan kelompok mikroorganisme yang berperan penting dalam memproteksi tanaman dari cendawan fitopatogen karena mampu memproduksi senyawa agroaktif, salah satunya mikolitk enzim terutama kitinase. Penelitian ini bertujuan mendeteksi aktivitas kitinase dan menganalisis keragaman gen penyandi kitinase famili 19. Sebanyak 50 isolat aktinomiset, 12 isolat (40%) dari rizosfer jagung dan 5 isolat (25%) dari rizosfer kedelai memiliki aktivitas kitinase yang diindikasikan dengan pembentukan zona bening di sekitar koloni pada media kitin agar 0.3% dengan rentang nilai indeks kitinolitik 0.49±0.01–2.15±0.69. Isolat terpilih (ARJ 36, ARJ 81, ARJ 15, ARK 17, ARK 143, dan ARK 103) memiliki aktivitas kitinase yang bervariasi pada pengujian secara kuantitatif dengan rentang nilai 0.157±0.04–0.440±0.09 U/mL. Aktivitas kitinase ini juga terkonfirmasi dengan terdeteksinya gen penyandi kitinase (~385 pb). Tujuh belas isolat teridentifikasi memiliki gen kitinase famili 19 dari Streptomyces dengan tingkat kemiripan 86%- 99.01% dibandingkan dengan basis data NCBI. Tujuh belas isolat kitinolitik tersebut memiliki potensi untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai agen biokontrol pengendali cendawan fitopatogen.