Keragaman Nukleotida Gen Bovine Lymphocyte Antigen DRB3 Ekson 2 pada Sapi Friesian Holstein Terkait Penyakit Mastitis

Abstract

Sapi Friesian Holstein (FH) tergolong ke dalam bangsa sapi perah sub - tropis yang berasal dari Friesland Belanda. Mastitis merupakan salah satu penyakit yang sering ditemukan pada sapi perah. Kompleks gen major histocompatibility complex yang dikenal dengan bovine lymphocyte antigene (BoLA) pada sapi merupakan kompleks gen yang berhubungan dengan sistem imun. Single strand conformation polymorphism (SSCP) merupakan salah satu metode yang sering digunakan dalam mendeteksi pola migrasi utas tunggal nukleotida. Penelitian ini bertujuan menganalisis keragaman nukleotida gen BoLA - DRB3 ekson 2 pada sapi FH. Penelitian menggunakan enam belas sampel DNA sapi FH yang terdiri atas sebelas sampel DNA FH normal dan lima sampel DNA FH terkena penyakit mastitis. Analisis keragaman dilakukan terhadap gen BoLA - DRB3 ruas ekson 2 dengan metode analisis runutan nukleotida (1 sampel sapi sehat dan 4 sampel sapi terkena mastitis) dan metode SSCP. Hasil analisis keragaman berdasarkan pola migrasi utas tunggal menunjukkan adanya sepuluh tipe molekul DNA dari enam belas sampel. Sampel FH 116 tidak terdeteksi tipe konformasi molekul nukleotidanya. Beberapa tipe konformasi molekul sampel sapi sehat sama dengan sampel sapi FH terdeteksi mastitis. Gen BoLA - DRB3 ekson 2 tidak dapat dijadikan marker penyakit mastitis pada sampel sapi FH.