Identifikasi Protein Signifikan Penyakit Kanker Payudara dengan Menggunakan Principal Component Analysis dan ClusterONE
Abstract
Penyakit kanker payudara adalah salah satu penyakit degeneratif yang
memiliki tingkat jumlah kasus baru setiap tahunnya yang tinggi di Indonesia.
Penyakit kanker payudara dapat diatasi dengan terapi yang menarget proteinprotein
signifikan yang berpengaruh terhadap penyakit tersebut. Identifikasi protein
signifikan dapat dilakukan dengan pendekatan topologi dan clustering. Untuk
mengidentifikasi protein signifikan penyakit kanker payudara, penelitian ini
menggunakan data centrality interaksi protein-protein yang dianalisis dengan
principal component analysis (PCA) dan clustering dengan ClusterONE. PCA
digunakan untuk mencari nilai overall centrality dari nilai-nilai centrality yang
digunakan dan dilakukan clustering untuk membentuk kompleks protein yang
berupa cluster berisi protein signifikan penyakit kanker payudara. Analisis cluster
dilakukan dengan perbandingan kualitas tiap cluster yang terbentuk dan terhadap
penelitian sebelumnya. Didapatkan sebanyak 27 protein merupakan protein yang
berpengaruh terhadap penyakit kanker payudara dari 32 protein cluster terbaik
Collections
- UT - Computer Science [1960]