Asosiasi Single Nucleotide Polymorphism dan Fenotipe pada Penyakit Diabetes Mellitus Tipe 2 Menggunakan Stepwise Regression
Abstract
Precision medicine merupakan penerapan ilmu medis untuk membuat profil
kelompok-kelompok individu berdasarkan karakteristik biologis unik dari setiap
individu tersebut. Saat ini precision medicine fokus terhadap penyakit kompleks
seperti Diabetes Mellitus tipe 2. Karakteristik biologis Diabetes Mellitus tipe 2
didapatkan dari marka DNA dan fenotipe. Marka DNA yang digunakan adalah
Single Nucleotide Polymorphism (SNP). Data SNP diambil dari Mouse Phenome
Database berdasarkan 22 kandidat protein mengenai Diabetes Mellitus tipe 2. Di
tahap praproses dilakukan pengisian missing value dan pengkodean pada data SNP.
Seleksi SNP sebagai fitur dilakukan dengan metode Stepwise Selection untuk
memilih SNP yang signifikan secara statistik. Data fenotipe yang digunakan adalah
insulin tolerance. Asosiasi SNP dan fenotipe insulin tolerance dilakukan dengan
metode Regresi Linier Berganda. Hasil asosiasi mendapatkan 8 SNP yang
berasosiasi secara signifikan terhadap fenotipe insulin tolerance berdasarkan
analisis Uji-T.
Collections
- UT - Computer Science [2254]