View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Fisheries and Marine Science
      • UT - Aquatic Resources Management
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Fisheries and Marine Science
      • UT - Aquatic Resources Management
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Aplikasi DNA Barcoding dan Metabarcoding pada Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus coioides) dan Jenis Makanannya dari Perairan Raja Ampat

      No Thumbnail [100%x80]
      View/Open
      Fulltext (10.05Mb)
      Date
      2019
      Author
      Yolanda, Yosa Anastesia
      Butet, Nurlisa Alias
      Madduppa, Hawis H
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Makanan merupakan sumber nutrisi bagi makhluk hidup tidak terkecuali untuk ikan dalam mempertahankan keberlangsungan hidup. Oleh karena itu perlu adanya pengkajian makanan melalui kebiasaan makanan ikan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi spesies ikan kerapu lumpur Epinephelus coioides melalui analisis DNA Barcoding serta keragaman jenis makanannya menggunakan analisis Metabarcoding dengan marka molekular gen COI. Sampel jaringan dianalisis dengan metode Sanger. Hasil identifikasi spesies melalui DNA Barcoding menunjukkan terdapat basa nukleotida sebanyak 643 pb dengan tingkat kemiripan sebesar 100%. Satu sampel isi perut ikan dianalisis dengan teknologi Next Generation Sequencing. Hasil penelitian menggunakan software MEGA 5.02 dari sampel isi perut didominasi oleh kelompok ikan sebesar 91,80% dan kelompok invertebrata sebesar 8,18%. Hasil serupa menggunakan software QIIME2 dengan referensi database MIDORI LONGEST, makanan didominasi oleh kelompok ikan E. coioides dengan frekuensi relatif berkisar 96% dan ivertebrata sebesar 2%.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/99057
      Collections
      • UT - Aquatic Resources Management [2593]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      NoThumbnail