View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biology
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biology
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      DNA Barcode Trigona terminata, T. drescheri, T. moorei dan T. thoracica berdasarkan Gen cytochrome oxidase 1 (CO1).

      Thumbnail
      View/Open
      Fulltext (10.55Mb)
      Date
      2015
      Author
      Sayusti, Tiara
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Lebah Trigona (Apidae: Meliponinae) yang termasuk ke dalam stingless bees memiliki keanekaragaman yang tinggi di daerah tropis. DNA Barcode adalah teknik identifikasi molekuler yang mendukung identifikasi morfologi berdasarkan sekuen DNA yang telah distandarisasi, pada hewan menggunakan gen cytochrome oxidase 1 (CO1) dari genom mitokondria (mtDNA). Sedikitnya database DNA Barcode Trigona membuat penelitian ini sangat penting untuk dilakukan. Penelitian ini bertujuan menganalisis sekuen gen CO1 Trigona terminata, T. drescheri, T. moorei dan T. thoracica. Empat spesies Trigona yang digunakan dalam penelitian ini berasal dari hutan karet dan desa Batu kucing, Jambi. Sekuen gen CO1 yang telah didapat dilakukan analisis bioinformatik serta konstruksi pohon filogeni menggunakan metode Maximum Parsimony. Penelitian ini menghasilkan parsial sekuen gen CO1 dari empat spesies Trigona dengan panjang sekuen berkisar antara 740-761 bp. Hasil analisis bioinformatik terhadap keempat sekuen tersebut menunjukan nilai homologi dan query cover mencapai 100 % serta e-value yang rendah. Pohon filogeni menunjukkan bahwa T. drescheri, T. laeviceps, T. terminata, T. moorei, dan T. thoracica tergabung ke dalam satu kelompok dengan nilai bootstrap 98 %. Selain itu, berdasarkan gen CO1 diketahui bahwa T. drescheri merupakan spesies terdekat dari T. laeviceps yang mendukung data morfologi yaitu kedua spesies Trigona tersebut berada dalam satu subgenus Tetragonula.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/98645
      Collections
      • UT - Biology [2396]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository