Identifikasi Gen Penyandi Enzim 3-hydroxy-3- methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR) pada Tanaman Penghasil Gaharu Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke

Abstract

Penanda molekuler serta identifikasi dan isolasi gen penyandi gaharu perlu dilakukan untuk seleksi bibit gaharu. Salah satu gen yang terlibat dalam proses pembetukan gaharu yaitu gen penyandi enzim 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR). Tujuan penelitian ini yaitu mengidentifikasi gen HMGR dan Actin pada tanaman penghasil gaharu Aquilaria malaccensis Lamk dan Gyrinops versteegii Domke. Penelitian ini dilakukan dengan cara mengisolasi DNA genom dan total RNA, sintesis cDNA, PCR dengan primer spesifik gen HMGR_1 dan QAct_1, dan sekuensing produk PCR. Amplikon diperoleh dengan A. malaccensis DNA template pada suhu annealing 54.8 oC untuk gen HMGR dan 57 oC untuk gen Aktin. PCR dengan G. versteegii DNA template teramplifikasi pada suhu annealing 54.8 oC untuk gen HMGR dan 55.8 oC untuk gen Aktin. Template cDNA pada A. malaccesnis dan G. versteegii teramplifikasi pada suhu annealing 56 oC untuk gen HMGR dan Aktin. Sekuens gen penyandi HMGR baik pada DNA genom dan cDNA dari kedua jenis tanaman sama dengan A. sinensis. Sedangkan sekuens gen Actin baik pada DNA genom dan cDNA dari kedua jenis tanaman sama dengan A. microcarpa pada gene bank.