Identifikasi Molekuler Bakteri pada Lobster Air Tawar di Situ Cilala dan Danau Lido, Kabupaten Bogor

Abstract

Populasi lobster air tawar telah diketahui berkembang dan menjadi invasif. Dampak yang ditimbulkan diantaranya penyebaran penyakit, antara lain disebabkan oleh bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri pada Cherax quadricarinatus yang ditumbuhkan di Rimler-Shotts Medium dan blood agar berdasarkan marka gen 16S rRNA di perairan Danau Cilala dan Danau Lido, Kabupaten Bogor. Bakteri diisolasi dari hepatopankreas lobster yang selanjutnya dilakukan perhitungan kepadatan total bakteri, identifikasi secara biokimia, serta identifikasi secara molekuler menggunakan gen 16S rRNA. Hasil identifikasi biokimia menunjukkan terdapat 20 jenis bakteri yang ditemukan dan sebagian besar merupakan Gram-negatif. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa bakteri AL 1 memiliki kemiripan sebesar 100% dengan Klebsiella variicola strain XF6. Bakteri AL 12 memiliki kemiripan urutan nukleotida sebesar 100% dengan Aeromonas caviae JCM 2362. Bakteri BL 8 memiliki kemiripan urutan nukleotida sebesar 99% dengan Exiguobacterium acetylicum strain ZLynn500-4. Isolat BL 9 memiliki kemiripan sebesar 99% dengan Klebsiella sp. strain SO8.