Optimasi Proses Kloning Genomik dan Identifikasi Gen Delta- Guaiene Sebagai Pembentuk Aroma Gaharu Pada Tanaman Aquilaria malaccensis Lamk
Abstract
Aroma wangi pada gaharu terbentuk oleh beberapa interaksi metabolisme
sekunder, salah satunya guaiene [C15H24]. Tujuan penelitian ini adalah untuk
optimasi proses kloning genomik dan identifikasi gen δ-guaiene sebagai pembentuk
aroma gaharu pada tanaman A. malaccensis Lamk. Kloning dilakukan dengan
metode shotgun sedangkan indentifikasi gen delta (δ)-guaiene dilakukan dengan
teknik PCR menggunakan primer spesifik. Optimasi proses kloning dimulai dengan
isolasi DNA genom, lalu dipotong dengan enzim restriksi EcoR1, purifikasi
fragmen DNA berukuran besar, yang kemudian direkatkan pada vektor pGemTEasy,
dan akhirnya ditransformasikan ke sel bakteri. Hasil transformasi berupa
koloni biru-putih, namun hasil PCR koloni menunjukkan bahwa koloni putih yang
ada tidak mengandung klon DNA insert, sehingga masih perlu modifikasi dan
optimasi lebih lanjut. PCR dengan primer spesifik gen δ-guaiene berhasil
mendapatkan fragmen dengan panjang basa 1449 bp. Nukleotida hasil sekuens yang
diperoleh mirip dengan sekuens gen δ-guaiene dari A. crassna, namun agak berbeda
dengan sekuens gen serupa dari A. malaccensis di pusat data NCBI.
Collections
- UT - Silviculture [1361]