Mengungkap Keanekaragaman Spesies dan Komposisi Ikan dari Ikan Karang Perikanan Tangkap Melalui DNA Barcoding dan Phylogenetika di Pulau Lombok.

Abstract

Keanekaragaman ikan karang di perairan Pulau Lombok berada dalam kondisi terancam oleh kegiatan penangkapan yang berlebih. Penurunan populasi terjadi sebagai dampak penangkapan ikan secara intensif dan berkelanjutan karena perikanan yang tidak terkelola dan tidak diatur. Tujuan dari penelitian ini untuk mengidentifikasi keanekaragaman ikan karang, karakteristik morfologi ikan karang yang unik terkait dengan konservasi, dan menyimpulkan pola filogenetik ikan karang di Lombok. Pengamatan keragaman ikan karang dengan mengumpulkan ikan-ikan didalam pasar dengan cara dihitung, mengklasifikasikannya kealam family. Amplifikasi DNA menggunakan marka mitokondria lokus 16S dan menggunakan metode BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) dan pohon filogenetik sesuai dengan sekuens pada database GenBank dengan membandingkan kesamaannya. Dari hasil GenBank dilakukan status konservasi pada IUCN Redlist (International Union for Conservation of Nature and Natural Resources) dan CITES (Konvensi Perdagangan Internasional Spesies Langka Fauna dan Flora Liar). Secara khusus, penelitian ini mengumpulkan data spesies ikan terumbu karang yang telah mendarat di Lombok barat dan timur. Sebanyak 341 ikan individu terhitung, mewakili 71 spesies yang termasuk dalam 22 famili, tiga alat tangkap, dan tiga belas tempat memancing. Dalam hal kekayaan spesies Siganidae adalah keluarga dominan di setiap lokasi. Metode BLAST dan pohon filogenetik menunjukkan kesamaan yang sangat tinggi dengan urutan yang sebelumnya disimpan pada database Genbank, dan hubungan filogenetik yang identik di antara spesies tersebut. Semua spesies yang dinilai oleh IUCN, dipisahkan menjadi lima kategori dan kebanyakan spesies tidak dievaluasi oleh CITES. Hasil penelitian ini diharapkan dapat membantu pemerintah untuk membentuk perlindungan dan kebijakan perdagangan ikan karang Indonesia.