View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Computer Science
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Computer Science
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Clustering Fragmen Metagenom Menggunakan K-means dan Ekstraksi Fitur GLCM dengan Variasi Coverage

      No Thumbnail [100%x80]
      View/Open
      Fulltext (13.23Mb)
      Date
      2017
      Author
      Viryagie, Gaza
      Kustiyo, Aziz
      Kusuma, Wisnu Ananta
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Analisis metagenom merupakan salah satu bidang kajian bioinformatika yang sedang berkembang saat ini. Bidang yang terkait analisis metagenom adalah genome sequencing dari sampel yang diperoleh langsung dari lingkungan (sampel metagenom). Sequencing dengan sampel metagenom tersebut dapat menyebabkan kesalahan perakitan fragmen dalam suatu kelompok mikroorganisme karena fragmen-fragmen yang dihasilkan bercampur. Oleh karena itu, diperlukan suatu algoritme yang tepat untuk mengelompokkan fragmen-fragmen dari organisme yang memiliki ciri sesuai dengan kelompok tersebut. Tujuan dari penelitian ini adalah menerapkan algoritme K-means dengan ekstraksi fitur dari Gray Level Cooccurrence Matrix (GLCM) pada tiap fragmen dengan variasi coverage. Hasil dari clustering dievaluasi dengan melihat nilai ragam yang diperoleh. Nilai ragam terkecil yang diperoleh adalah sebesar 0.1172 pada coverage 10 dan jumlah cluster sebanyak 11.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/87564
      Collections
      • UT - Computer Science [2337]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      NoThumbnail