Keragaman Gen Heat Shock Protein 70 pada Ayam Kampung, Ayam Arab, dan Ayam Ras

Abstract

Penelitian bertujuan untuk mengidentifikasi kergamanan gen heat shock protein/HSP-70 ayam kampung, ayam arab, dan ayam ras. Penelitian menggunakan sampel darah yang diambil dari vena brakhialis/sayap pada sekelompok ayam umur 12 minggu yang dipelihara semenjak umur sehari/Day Old Chick (DOC). DOC ayam kampung diperoleh dari hasil penetasan sendiri dengan telur tetas didatangkan dari daerah dataran rendah, sedang, dan dataran tinggi di Pulau Lombok, sedangkan DOC ayam arab diperoleh dari peternak, dan DOC ayam ras dibeli di poultry shop. Genotyping dilakukan menggunakan analisis Polymerase Chain Reaction (PCR) - Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) menunjukkan bahwa gen HSP-70 bersifat polimorfik pada ayam kampung dan ayam arab, sedangkan pada ayam ras monomorfik. Pada ayam kampung terdapat tujuh genotipe HSP-70 yaitu AA, AB, AC, CC, AD, DD, dan BC dengan frekuensi tertinggi genotipe AD, sedangkan pada ayam arab terdapat enam genotipe, yaitu AA, AB, AC, CC, AD, dan BC, dengan frekuensi tertinggi genotipe AC. Pada ayam ras terdapat satu genotipe yaitu DD. Dijumpai tujuh situs (lokasi) polimorfik, yaitu perubahan A�����G pada situs 617, perubahan A�����G pada situs 628, perubahan G�����C pada situs 646, perubahan C�����T pada situs 661, perubahan A�����G pada situs 699, perubahan G�����C pada situs 754, dan perubahan A�����G pada situs 792. Mutasi pada situs 628, 646 dan 661 tergolong silent mutation. Gen HSP-70 pada populasi ayam kampung dan ayam arab dalam penelitian ini tidak berada dalam keseimbangan, Hardy-Weinberg. Tidak dijumpai adanya perbedaan yang mencolok antara nilai heterosigositas observasi dan heterosigositas harapan, serta nilai polymorphic informative content ayam kampung dan ayam arab. Gen HSP 70 bersifat polimorfik pada ayam kampong dan ayam arab, sertas monomorfik pada ayam ras.