Sistematika Molekuler Dna Barcoding Dan Keanekaragaman Genetika Lamun Di Pulau Panggang, Pulau Pramuka Dan Pulau Karya, Kepulauan Seribu, Jakarta

Abstract

Lamun merupakan tumbuhan yang berkembang baik di perairan laut. Kerusakan fisik banyak terjadi dalam ekosistem ini sehingga menyulitkan dalam kegiatan identifikasi morfologi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi sekaligus membuat rekonstruksi dan keragaman genetik pada lamun. Tahapan yang digunakan ada tiga, yaitu ekstraksi, PCR dan elektroforesis. Target penanda untuk amplifikasi DNA adalah MatK dan rbcl. Hasil dari amplifikasi dua lokus yang teramplifikasi dengan baik berjumlah 71 sampel dari total sampel 90. Urutan nukleotida yang didapat dari lokus MatK sebanyak 661 bp dan rbcl 512 bp. Nilai transisi pada kedua lokus lebih besar dari transversi. Jarak genetik masing-masing spesies bisa dilihat dari matriks jarak genetik ataupun dari pohon filogenetik. Nilai jarak terdekat antara Syringodium isoetifolium dengan Cymodocea rotundata sebesar 0,040 untuk MatK dan jarak terdekat antara Enhalus acoroides dengan Thalassia hemprichii sebesar 0,016 untuk rbcl.