Studi Filogenetik dan Identifikasi Molekuler Anggrek Phalaenopsis sp Menggunakan Marka Mikrosatelit

Abstract

Anggrek merupakan tanaman hias yang sangat populer karena memiliki jenis yang beragam dan diperhitungkan sebagai tanaman penting dalam industri florikultur di Indonesia. Faktor Pembatas keberhasilan persilangan adalah tanaman ini memiliki fase juvenil yang relatif panjang, persilangan antar individu yang berkerabat jauh biasanya sulit. dilakukan, dan apabila diperoleh hibrida, biji yang dihasilkannya sukar berkecambah atau steril. Oleh karena itu untuk mencapai keberhasilan dalam perbaikan genetik melalui persilangan, perlu mengetahui hubungan kekerabatan antar tetua yang dipiIih sebagai bahan persilangan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi secara molekuler beberapa spesies anggrek Phalaenopsis yang ada di Indonesia dan melihat hubungan kekerabatan dari spesies-spesies yang ada. Dalam studi ini, dilakukan karakterisasi kekerabatan genetik menggunakan marka DNA mikrosatelit untuk 13 Phalaenopsis spesies di Indonesia. Sebanyak 164 alel terdeteksi pada 12 primer mikrosatelit dari 13 spesies anggrek Phaiaenopsis. Jumlah alel per lokus antara 2 alel (Pman02, Pam8, PGA6) hingga 5 alel (Plue6) dengan rata-rata 3.3 alel dari 12 loci. Nilai PIC berkisar antara 0.1319 (Pam8 and PGA6) hingga 0.6580 (Plue6) dengan rata-rata 0.4795. Berdasarkan unrooted neighbor-joining tree hubungan kekerabatan pada 13 anggrek Phaiaenopsis terbagi menjadi 4 major klaster. Klaster 1 terdiri dari P. Iueddemanniana,• P.conucervi, P. violaceae, P. gigantea. Klaster 2 terdiri dari P. schilleriana, P. mannii, P . florescens, P. bellina. Klaster 3 terdiri dari P. amabilis, P. fuscata, P. zebrina, P. javanica. dan Klaster 4 yaitu P. amboinensis.