Karakterisasi Genom Mitokondria Labi-Labi, Dogania subplana (Trionychidae, Testudines, Reptilia)

Abstract

Runutan nukleotida lengkap genom mitokondria (mtDNA) labi-labi, Dogania subplana, telah dilakukan. Ukuran mtDNA labi-labi adalah 17289 bp. Organisasi, orientasi dan ukuran setiap gen dari 13 gen penyandi protein mtDNA, 22 gen penyandi tRNA dan dua gen penyandi rRNA serta daerah kontrol adalah serupa dengan yang telah ditemukan pada vertebrata lainnya. Panjang daerah kontrol adalah 1820 bp, yang di dalamnya bisa ditemukan tiga motif runutan DNA berulang. Motif pertama dan kedua berturut-turut adalah 15 bp dan 37 bp, yang keduanya berulang secara tandem sampai 728 bp. Motif ketiga adalah ruas TA berulang, yaitu (TA)n dan (ATAlT)n. Motif ketiga ini disebut mitokondria. Analisis terhadap daerah kontrol menemukan adanya domain tengah yang stabil untuk semua anggota Testudines, dan adanya tiga macarn Conserve Sequence Blocks yang homolog dengan daerah kontrol mtDNA vertebrata.