Identifikasi Molekuler Trips pada Tanaman Bawang Merah (Allium cepa aggregatum) Asal Cianjur dan Majalengka Provinsi Jawa Barat

Abstract

Trips merupakan salah satu hama utama bawang merah (Allium cepa aggre-gatum) yang dapat menurunkan hasil panen dan berperan sebagai vektor virus tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengarakterisasi keragaman molekuler Trips pada bawang merah yang berasal dari Cianjur dan Majalengka, Jawa Barat. Sampel trips diambil dari dua lokasi yaitu Cianjur dan Majalengka, diidentifikasi secara morfologi dan molekuler. Analisis molekuler dengan menggunakan marker penanda cytochrome c oxidase subunit I (COI) melalui teknik Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sekuensing DNA. Amplifikasi DNA menghasilkan fragmen berukuran sekitar 700 pb yang sesuai dengan target gen COI. Hasil analisis BLAST menunjukkan sampel trips asal Cianjur (T1) memiliki tingkat kemiripan 99,5% sampai 100% dengan sekuens Thrips tabaci dari negara lain, sedangkan sampel trips T2 asal Cianjur dan M1, M2, Serta M3 asal Majalengka menunjukkan kesamaan sekuen yang identik, menegaskan bahwa seluruh isolat lapangan berasal dari spesies yang sama dan berada dalam satu kelompok genetik. Tingkat homologi sekitar 90,9% sampai 91,6% terhadap isolat negara lain menunjukkan bahwa isolat tersebut termasuk dalam genus Thrips, namun belum memungkinkan penentuan hingga tingkat spesies, sehingga mengindikasikan potensi sebagai spesies lokal atau spesies kriptik yang belum terwakili dalam basis data global. Penggunaan Spodoptera litura sebagai outgroup mengonfirmasi keandalan analisis homologi dan pemisahan filogenetik, serta menegaskan pentingnya pendekatan molekuler untuk mendukung akurasi identifikasi trips sebagai dasar pengelolaan hama dan vektor virus pada bawang merah.