Show simple item record

dc.contributor.advisorMiftahudin
dc.contributor.advisorHarmoko, Rikno
dc.contributor.authorMaulina, Agustia
dc.date.accessioned2026-01-23T08:45:55Z
dc.date.available2026-01-23T08:45:55Z
dc.date.issued2026
dc.identifier.urihttp://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/172301
dc.description.abstractProtein Human Fibroblast Growth Factor-2 (FGF-2) berfungsi sebagai regulator dalam mekanisme proliferasi, diferensiasi dan migrasi sel. Aktivitas biologisnya untuk mensintesis kolagen dan regenerasi tulang. Tingginya biaya produksi rekombinan human FGF-2 mendorong pengembangan sistem ekspresi rekombinan yang lebih terjangkau. Optimalisasi produksi protein human FGF-2 dapat dicapai menggunakan teknik kloning molekular menggunakan vektor ekspresi dengan variasi posisi His-tag. Strategi ini menempatkan posisi His-tag pada ujung gen yaitu pada ujung 5' dan 3'. Desain variasi posisi His-tag bertujuan untuk menghasilkan protein dengan label N-terminal dan C-terminal, serta mengevaluasi efisiensi translasi dan stabilitas protein. Penelitian ini bertujuan untuk mengkonstruksi dua vektor ekspresi gen human FGF-2 dilengkapi dengan His-tag N-terminal dan C-terminal dan ditransformasikan pada Agrobacterium tumefaciens GV3101. Evaluasi lanjutan dari konstruksi gen human FGF-2 akan menentukan posisi His-tag yang optimal dalam produksi rekombinan human FGF-2. Penelitian ini berhasil mengklon gen human FGF-2 dengan His-tag N-terminal dan C-terminal pada masing-masing ujung 5' dan 3' ke dalam vektor pTA2. Konfirmasi keberhasilan kloning dibuktikan melalui digesti enzim restriksi NdeI dan SacI pada plasmid rekombinan N1 (pTA-N6His-FGF2) dan C1 (pTA2-FGF2-C6His). Verifikasi dilanjutkan dengan analisis sekuen trasngen menggunakan metode Sanger sequencing. Hasil skuensing menunjukkan fragmen sepanjang 498 bp dari transgen human FGF-2. Analisis BLASTn terhadap sekuens tersebut menghasilkan nilai e-value 0,0 dan identitas 100%. Hasil ini mengonfirmasi keakuratan sekuen sisipan gen human FGF-2 beserta His-tagnya pada kedua konstruk. Selanjutnya sisipan gen human FGF-2 beserta His-tagnya disebut N6His-FGF2 untuk posisi His-tag pada ujung 5' dan FGF2-C6His untuk posisi His-tag pada ujung 3' dari gen human FGF-2 pada plasmid pTA2. Hasil subklon N6His-FGF2 dan FGF2-C6His ke dalam vektor ekspresi pRI-101-AN menghasilkan plasmid rekombinan N1 (pRI-101-AN-N6His-FGF2) dan C1 (pRI-101-AN-FGF2-C6His). Digesti enzim NdeI dan SacI mengonfirmasi keberhasilan subkloning dengan pita DNA berukuran ? 500 bp sebagai vektor ekspresi gen human FGF-2. Keberhasilan transformasi vektor ekspresi ke dalam A. tumefaciens GV3101 dikonfirmasi menggunakan teknik PCR koloni dengan primer spesifik gen human FGF-2. Hasil penelitian ini membuktikan keberhasilan konstruksi vektor ekspresi gen human FGF-2 dengan His-tag pada N-terminal dan C-terminal. Agrobacterium yang telah membawa vektor ekspresi rekombinan akan digunakan untuk analisis ekspresi sementara pada tembakau dengan metode agroinfiltrasi.
dc.description.abstractHuman Fibroblast Growth Factor-2 (FGF-2) serves as a pivotal regulator in the mechanisms of cellular proliferation, differentiation, and migration. The biological activities of human FGF-2 are essential for collagen synthesis and bone regeneration. The prohibitive cost of commercial recombinant human FGF-2 has necessitated the development of more affordable recombinant expression systems. The optimization of human FGF-2 production can be achieved through molecular cloning techniques using expression vectors with variable polyhistidine (His)-tag positioning. This strategy involves integrating the His-tag at the 5' and 3' termini of the gene to generate proteins with N-terminal and C-terminal labels, respectively, facilitating the evaluation of translational efficiency and protein stability. This study aimed to construct two human FGF-2 expression vectors featuring N-terminal and C-terminal His-tags and subsequently transformed them into Agrobacterium tumefaciens GV3101. Future evaluations of these constructs will determine the optimal His-tag orientation for maximizing recombinant human FGF-2 yield. In this study, the human FGF-2 gene was successfully cloned with N-terminal and C-terminal His-tags at the 5' and 3' ends, respectively, into the pTA2 vector. Cloning success was validated via restriction digestion using NdeI and SacI enzymes on recombinant plasmids N1 (pTA-N6His-FGF2) and C1 (pTA2-FGF2-C6His). Verification was further conducted using Sanger sequencing, which identified a 498 bp fragment of the human FGF-2 transgene. BLASTn analysis of the sequence yielded an E-value of 0.0 and 100% identity, confirming the sequence fidelity of the human FGF-2 insert and its respective His-tags in both constructs. Subsequently, the N6His-FGF2 and FGF2-C6His inserts were subcloned from the pTA2 plasmid into the pRI-101-AN expression vector, resulting in recombinant plasmids N1 (pRI-101-AN-N6His-FGF2) and C1 (pRI-101-AN-FGF2-C6His). Restriction digestion with NdeI and SacI confirmed successful subcloning, indicated by a DNA band of approximately 500 bp. The successful transformation of these expression vectors into Agrobacterium tumefaciens GV3101 was confirmed via colony PCR using human FGF-2-specific primers. These results demonstrate the successful construction of human FGF-2 expression vectors with N-terminal and C-terminal His-tags. The engineered Agrobacterium strains will be utilized for transient expression analysis in tobacco via the agroinfiltration method.
dc.description.sponsorshipBadan Riset Nasional dan Inovasi (BRIN)
dc.language.isoid
dc.publisherIPB Universityid
dc.titleKloning Dan Transformasi Gen Human Fibroblast Growth Factor-2 (FGF-2) Pada Agrobacterium tumefeciens GV3101id
dc.title.alternativeCLONING AND TRANSFORMATION OF HUMAN FIBROBLAST GROWTH FACTOR-2 GENE (FGF-2) INTO Agrobacterium tumefaciens GV3101
dc.typeTesis
dc.subject.keywordkloningid
dc.subject.keywordHis-tagid
dc.subject.keywordhuman FGF-2id
dc.subject.keywordprotein rekombinanid


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record