View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biochemistry
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biochemistry
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Analisis Metagenomik Keragaman Bakteri Pada Tanah Kawasan Rawa Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai Sulawesi Tenggara

      Thumbnail
      View/Open
      Cover (599.0Kb)
      Fulltext (1.677Mb)
      Lampiran (1.630Mb)
      Date
      2025
      Author
      KURNIAWAN, MUHAMMAD KUKUH
      Pratama, Rahadian
      Andrianto, Dimas
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai merupakan salah satu kawasan konservasi yang memiliki ekosistem rawa dengan potensi biodiversitas mikroba yang cukup tinggi. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keanekaragaman komunitas bakteri tanah di ekosistem rawa TNRAW serta gen fungsional. Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel tanah dari lima titik, ekstraksi DNA, pengukuran kualitas DNA serta sekuensing dilakukan dengan Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo. Analisis data menggunakan platform UseGalaxy dan RStudio. Jumlah bacaan (reads) tertinggi diperoleh sebanyak 112.936 reads, dengan klasifikasi komunitas mikrobioma mencapai 82,3% yang didominasi genus Photobacterium, Vibrio, dan Escherichia. Anotasi gen fungsional mengidentifikasi enam gen utama, yaitu menC, fmt, gpml, gltX, purB_1, dan purB_2, yang terlibat dalam berbagai jalur metabolisme penting. Simpulan penelitian ini adalah komunitas bakteri di kawasan TNRAW tidak hanya beragam secara taksonomi, tetapi juga berpotensi berkontribusi terhadap proses biogeokimia, termasuk siklus nitrogen, sulfur, dan karbon.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/169798
      Collections
      • UT - Biochemistry [1463]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository