Analisis Metagenomik Keragaman Bakteri Pada Tanah Kawasan Rawa Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai Sulawesi Tenggara
Date
2025Author
KURNIAWAN, MUHAMMAD KUKUH
Pratama, Rahadian
Andrianto, Dimas
Metadata
Show full item recordAbstract
Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai merupakan salah satu kawasan konservasi yang memiliki ekosistem rawa dengan potensi biodiversitas mikroba yang cukup tinggi. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi keanekaragaman komunitas bakteri tanah di ekosistem rawa TNRAW serta gen fungsional. Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel tanah dari lima titik, ekstraksi DNA, pengukuran kualitas DNA serta sekuensing dilakukan dengan Oxford Nanopore Technologies PromethION 2 Solo. Analisis data menggunakan platform UseGalaxy dan RStudio. Jumlah bacaan (reads) tertinggi diperoleh sebanyak 112.936 reads, dengan klasifikasi komunitas mikrobioma mencapai 82,3% yang didominasi genus Photobacterium, Vibrio, dan Escherichia. Anotasi gen fungsional mengidentifikasi enam gen utama, yaitu menC, fmt, gpml, gltX, purB_1, dan purB_2, yang terlibat dalam berbagai jalur metabolisme penting. Simpulan penelitian ini adalah komunitas bakteri di kawasan TNRAW tidak hanya beragam secara taksonomi, tetapi juga berpotensi berkontribusi terhadap proses biogeokimia, termasuk siklus nitrogen, sulfur, dan karbon.
Collections
- UT - Biochemistry [1463]
