| dc.contributor.advisor | Pratama, Rahadian | |
| dc.contributor.advisor | Andrianto, Dimas | |
| dc.contributor.author | Nuranisa, Yana | |
| dc.date.accessioned | 2025-07-07T08:58:21Z | |
| dc.date.available | 2025-07-07T08:58:21Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.identifier.uri | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/164069 | |
| dc.description.abstract | Indonesia sebagai negara megabiodiversitas, masih sangat terbatas dalam
studi mikrobiom tanah hutan primer, khususnya di kawasan Wallacea seperti
Taman Nasional Rawa Aopa Watumohai, Sulawesi Tenggara. Penelitian ini
bertujuan mengeksplorasi keanekaragaman dan potensi genetik mikrobiom bakteri
tanah hutan primer TNRAW menggunakan sekuensing metagenomik PromethION
2. Lima sampel tanah (F1-F5) dianalisis melalui metode ekstraksi DNA, quality
control, sekuensing, dan analisis bioinformatika. Konsentrasi DNA sampel berkisar
57–74 ng/µL. Hasil sekuensing menunjukkan sampel F3 memiliki hasil terbaik
(total basa 32.488.214 dengan 81.092 reads; N50 88.482 bp). Komunitas bakteri
didominasi oleh Vibrionaceae dan Rhizobiaceae. Analisis multivariat (NMDS,
heatmap) mengindikasikan perbedaan struktur komunitas antar lokasi, dengan F5
paling unik. Anotasi gen fungsional mengidentifikasi gen kunci (rne, infB_1, ftsH)
yang terlibat dalam metabolisme dan adaptasi mikroba tanah. Hasil penelitian ini
menegaskan urgensi eksplorasi mikrobiom tanah dalam upaya pengelolaan dan
konservasi ekosistem hutan primer. | |
| dc.description.sponsorship | Peneliti SPUN yaitu Dr. Valeria Verone dari National University of
Singapore (NUS), dan Yayasan Satriabudi Dharma Setia | |
| dc.language.iso | id | |
| dc.publisher | IPB University | id |
| dc.title | Eksplorasi Diversitas Mikrobiom Tanah Hutan Primer TNRAW Menggunakan PromethION 2 Berbasiskan Metagenomics | id |
| dc.title.alternative | Exploration of Soil Bacterial Microbiome Diversity in TNRAW Primary Forest Using PromethION 2-Based Metagenomic Sequencing. | |
| dc.type | Skripsi | |
| dc.subject.keyword | Biodiversitas | id |
| dc.subject.keyword | sekuensing | id |
| dc.subject.keyword | bioinformatika | id |
| dc.subject.keyword | mikrobiom | id |
| dc.subject.keyword | hutan primer | id |
