Keragaman Insersi G.1390 di daerah 5’UTR Gen HSP70 menggunakan metode PCR-RFLP pada Sapi Bali

Abstract

Gen HSP70 adalah salah satu gen yang berfungsi mengatur stres panas pada ternak sapi. Studi ini bertujuan menganalisis keragaman gen HSP70 menggunakan metode PCR-RFLP pada sapi bali warna rambut normal dan albino. Sampel DNA yang digunakan terdiri dari 38 sampel sapi Bali, yang terdiri dari 18 individu dengan warna rambut albino dan 20 individu tipe normal. Keragaman genetik dari gen HSP70 dinilai dengan menghitung frekuensi genotipe dan alel, nilai heterozigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg menggunakan program PopGen32. Selanjutnya, genotyping dilakukan menggunakan PCR-RFLP untuk menentukan keragaman dalam warna rambut albino dan normal pada sapi Bali. Dimana dengan mengidentifikasi keragaman pada sapi Bali,akan memungkinkan untuk menentukan praktik pembiakan yang sesuai, terutama untuk sapi Bali albino. Dimana dari hasil analisis ditemukan bahwa tidak terdapatnya keragaman insersi pada gen HSP70 dari sapi bali normal maupun albino sehingga insersi pada gen HSP70 sapi bali tidak dapat digunakan sebagai pembeda pada sapi bali albino dan sapi bali normal.

Our study's subject is the HSP70 gene, a key regulator of cattle's heat stress. We aim to analyze the diversity of Bali cattle, including those with standard hair color and unique albino traits. Our DNA samples include 38 Bali cattle, evenly split between the two groups. We assess the genetic diversity of the HSP70 gene by calculating genotype and allele frequencies, heterozygosity values, and Hardy-Weinberg equilibrium using the PopGen32 program. Subsequently, genotyping conducted using PCR-RFLP to determine diversity in albino and standard fur color in Bali cattle. Our thorough research process ensures that the results are reliable and can be used to provide valuable insights for breeding practices, particularly for albino Bali cattle, potentially improving their health and well-being. The analysis revealed no insertion variation in the HSP70 gene of ordinary and albino Bali cattle, so insertions in the HSP70 gene cannot be used as a distinguishing marker between albino and ordinary Bali cattle.