Studi Penambatan Molekul Elemen Escherichia coli K-12 sebagai Aplikasi Biosensor untuk Mendeteksi Bahan Peledak 2,4,6-Trinitrotoluena

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan mekanisme interaksi protein dari E. coli yaitu yadG dan aspC dengan senyawa TNT dan senyawa lainnya yang dapat diaplikasikan untuk mengembangkan sebuah biosensor. TNT adalah senyawa yang sangat berbahaya dan sering digunakan sebagai bahan peledak. Deteksi TNT dengan cepat dan akurat penting untuk keamanan publik dan lingkungan. Penelitian ini menggunakan metode penambatan molekul untuk memprediksi interaksi antara senyawa TNT dengan reseptor yadG dan aspC. Analisis binding energy menunjukkan bahwa interaksi antara reseptor yadG dan ligan TNT memiliki afinitas yang tinggi dan stabil. Hal ini menandakan potensi yang baik untuk penggunaan sebagai elemen promotor dalam pembuatan biosensor dengan sensitivitas tinggi terhadap TNT. Dibandingkan dengan reseptor aspC, yadG memiliki kinerja yang lebih baik dalam mendeteksi TNT.

This research aims to elucidate the protein interaction mechanisms of E. coli, namely yadG and aspC, with TNT and other compounds, which can be applied to develop a biosensor. TNT is a highly hazardous compound often used as an explosive material. Rapid and accurate detection of TNT is crucial for public safety and environmental protection. This research utilized molecular docking method to predict the interaction between TNT compound and yadG and aspC receptors. Analysis of binding energy indicated that the interaction between yadG receptor and TNT ligand exhibited high and stable affinity. This signifies its potential for utilization as a promoter element in biosensor development with high sensitivity towards TNT. In comparison to the aspC receptor, yadG demonstrated superior performance in TNT detection.