| dc.description.abstract | Gen mioglobin (MB) mengkode protein mioglobin, protein yang ditemukan
dalam jaringan otot, berfungsi untuk mengikat dan menyimpan oksigen. Mioglobin
tidak hanya diekspresikan pada otot rangka dan jantung, tetapi juga diekspresikan
pada sel endotel dan jaringan lain seperti otak dan hati. Mineral secara umumnya
bertanggung jawab atas berbagai reaksi biokimia dan fungsi fisiologis dalam tubuh.
Mineral mendorong pertumbuhan, reproduksi, dan produksi ternak secara optimal.
Mineral yang dianalisis pada penelitian ini adalah Fe, Se, Zn, dan Mn. Mineralmineral ini memiliki fungsi antioksidan. Ayam IPB-D1 merupakan ayam pedaging
lokal ras komposit yang dikembangkan oleh Fakultas Peternakan Institut Pertanian
Bogor. Keunggulan ayam persilangan baru ini adalah pertumbuhannya yang cepat,
kualitas daging yang tinggi, serta ketahanan terhadap penyakit khususnya
Newcastle Disease (ND) dan Salmonella sp. Ayam IPB-D2 merupakan hasil seleksi
ayam IPB-D1 generasi ke-9 yang diseleksi dengan kadar IgY di atas 10 mg mL
-1
dalam serum darahnya.
Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis polimorfisme gen MB pada ayam,
mengkaji asosiasinya dengan kandungan mineral daging, dan menganalisis
ekspresinya pada jaringan otot hati dan paha ayam IPB-D2. Sebanyak 55 ekor ayam
jantan IPB-D2 berusia 10-12 minggu digunakan dalam penelitian ini. Identifikasi
polimorfisme gen, kuantifikasi kandungan mineral, dan ekspresi gen dilakukan
masing-masing menggunakan metode direct sequencing, metode Atomic
Absorption Spectroscopy (AAS), dan qRT-PCR. Jaringan otot paha dan hati
digunakan sebagai sumber mRNA dalam penelitian ini. Metode analisis statistik
yang digunakan adalah uji chi-square untuk menguji kesetimbangan HardyWeinberg, dan uji T untuk analisis asosiasi mineral dan analisis ekspresi gen.
Daging paha ayam IPB-D2 rata-rata mengandung mineral Fe, Se, Zn, dan Mn
sebesar 17,81; 0,22; 16,50; 0,34 mg kg-1
. Dari hasil sequensing ditemukan dua SNP
pada 5'UTR gen MB ayam IPB-D2, yaitu SNP g.17 G>T dan SNP g.25 T>C.
Genotipe TT (g.17 G>T) dan genotipe CC (g.25 T>C) berasosiasi nyata (P<0,05)
dengan kandungan Fe tinggi pada ayam IPB-D2. Analisis ekspresi gen
menunjukkan bahwa ekspresi gen MB di hati tidak berbeda secara statistik antara
kombinasi genotipe GG/TT, GT/TC, dan TT/CC. Sedangkan pada otot paha,
ekspresi gen MB pada kombinasi genotipe TT/CC lebih tinggi signifikan (P<0,05)
dibandingkan kombinasi genotipe GG/TT dan GT/TC. Hasil ini menunjukkan
bahwa polimorfisme yang teridentifikasi pada gen MB IPB-D2 dapat menjadi
referensi untuk menyelidiki gen serupa pada rasa ayam lain, khususnya terkait
kandungan mineral Fe, Se, Zn, dan Mn. | id |
