Identifikasi molekuler dan keragaman genetik spons invasif Terpios hoshinota di Pulau Dapur, Kepulauan Seribu

Abstract

Terpios hoshinota merupakan salah satu spesies spons invasif yang menyebarluas di perairan Indo-Pasifik. Penyebaran Terpios hoshinota di Indonesia telah ditemukan di Kepulauan Spermonde dan Kepulauan Seribu. Namun demikian, spons mempunyai keanekaragaman spesies yang tinggi tetapi dikenal sebagai organisme yang sulit diidentifikasi secara morfologi. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi Terpios hoshinota secara genetik, menganalisis keragaman genetik serta merekonstruksi pohon filogenetik Terpios hoshinota di Pulau Dapur, Kepulauan Seribu. Amplifikasi DNA dengan gen CO1 mengidentifikasi Terpios hoshinota dengan tingkat kemiripan 95 % - 99 %. Rata-rata panjang nukleotida 679 basepairs, rata-rata komposisi timin (T)= 37 %; sitosin (C)= 18.6 %; adenin (A)= 23 % dan guanin (G)= 21.4 %. Keragaman genetiknya yaitu 0.0962 (keragaman haplotiope) dan 0.4412 ± 0.2574 (keragaman nukleotida). Hasil analisis filogenetik menggunakan model Neighbor Joining Treedengan model substitusi Kimura 2-parameter menunjukkan 6 individu sampel Terpios hoshinota di Pulau Dapur mempunyai kekerabatan yang dekat.