Studi Awal Distribusi Ikan Pari Gergaji di Indonesia Menggunakan Metode DNA Lingkungan (eDNA)

Abstract

Metode DNA lingkungan sangat baik untuk identifikasi organisme di laut. Terlebih, masih banyak spesies yang sulit diidentifikasi karena kelangkaannya berdasarkan metode visual census. Studi ini berfokus pada implementasi DNA lingkungan di Indonesia untuk menginvestigasi spesies ikan pari gergaji (Anoxypristis cuspidata) yang terancam punah. Sampel air DNA lingkungan sebanyak 4 L didapatkan dari 6 lokasi di dekat perairan terumbu karang Indonesia yaitu Jakarta, Probolinggo, Selayar, Misol, serta Maluku Utara dan disaring 0.4 μm. DNA diekstraksi dari sampel yang sudah disaring, lalu diamplifikasi PCR menggunakan cytochrome c oxidase subunit I (COI) primer untuk amplifikasi DNA, lalu dilanjutkan ke tahap sequencing dan dianalisis oleh Next Generation Sequencing. Hasil dari analisis tersebut mengungkapkan bahwa di perairan Indonesia terdapat ikan hiu gergaji, hal tersebut juga membuktikan bahwa metode DNA lingkungan dapat mendeteksi spesies yang tergolong langka. Pendekatan DNA lingkungan untuk mengidentifikasi ikan pari gergaji dapat menghasilkan hasil yang dapat diandalkan dan juga dapat digunakan sebagai alat survey untuk melindungi spesies terancam dan dilindungi.