Analisis Pakan Badak Jawa (Rhinoceros sondaicussondaicus) Menggunakan Marka DNA Barkode Gen Kloroplas maturase K (matK)
Date
2021Author
Rizki, Rauzul Rudiansyah
Solihin, Dedy Duryadi
Hadisunarso
Metadata
Show full item recordAbstract
Badak jawa (Rhinoceros sondaicus sondaicus) merupakan salah satu satwa
yang ada di Indonesia yang kini keberadaannya terancam punah dan diperkirakan
jumlahnya kurang lebih 62 individu pada tahun 2013, dan saat ini hanya dapat
ditemukan di Taman Nasional Ujung Kulon (TNUK), Banten. Saat ini, faktor pakan
badak jawa menjadi hal yang krusial bagi keberlangsungan hidup spesies tersebut
karena luasan serta kualitas pakannya sangat terancam karena adanya kerusakan
hutan. Tujuan penelitian ini adalah memberikan informasi pakan badak jawa secara
tepat dan aktual melalui proses barcoding DNA tumbuhan dari feses badak jawa
yang telah dikoleksi dari TNUK, Banten. DNA total didapatkan dari 10 sampel
feses badak jawa dan 10 tumbuhan yang diduga sebagai pakan badak jawa. PCR
dilakukan dengan menggunakan primer spesifik tumbuhan marka matK. Analisis
sekuen yang didapat di BLAST-n kemudian diolah menggunakan MEGA 7 untuk
dilihat identitas dan kekerabatannya. Hasil analisis 10 sampel feses mendapatkan
Leea coccinea dari famili Vitaceae diduga sebagai pakan favorit badak jawa.
Sumber pakan lainnya adalah tumbuhan Terminalia guyanensis (Combretaceae),
Morus celtidifolia (Moraceae), dan Dillenia indica (Dilleniaceae). Dari 10 sampel
tumbuhan diduga pakan badak jawa salah satu diantaranya yaitu sampel tumbuhan
sulangkar (Leea indica) memiliki jarak genetik yang paling dekat dengan sampel
feses yang teridentifikasi sebagai Leea coccinea yaitu perbedaannya berkisar 1.59–
1.71% (0.0159–0.0171). Hal ini menunjukkan sulangkar (Leea indica) diduga
sebagai pakan favorit badak jawa. Ketidakcocokan tersebut diduga belum
terdapatnya database sulangkar (Leea indica) di GenBank. The Javan rhino (Rhinoceros sondaicus sondaicus) is one of the animals
in Indonesia which is now threatened with extinction. It was estimated that its
number was around 62 individuals in 2013, and currently can only be found in
Ujung Kulon National Park, Banten. At present, the Javan rhino forage is crucial
for the survival of this species because the area and quality of its food are seriously
threatened due to forest destruction. The purpose of this study was to provide
accurate and actual information on Javan rhino food through the process of
barcoding plant DNA from Javan rhino faeces that had been collected from Ujung
Kulon National Park, Banten. Total DNA was obtained from 10 Javan rhino faeces
and 10 plants suspected of being Javan rhino feed. PCR was performed using
specific primers for the matK marker plant. Sequence analysis obtained in BLASTn was then processed using MEGA 7 to see its identity and kinship. The results of
the analysis of 10 stool samples found Leea coccinea from the Vitaceae family,
which is thought to be the favorite food of Javan rhinos. Other food sources are
Terminalia guyanensis (Combretaceae), Morus celtidifolia (Moraceae), and
Dillenia indica (Dilleniaceae). From 10 of the plant samples, Leea indica had a
genetic distance that was very close to the fecal samples identified as ranging from
1.59-1.71% (0.0159-0.0171). This shows that the sulangkar, (Leea indica) is
thought to be the Javan rhino's favorite food. This discrepancy is thought to have
not yet existed in the sulangkar (Leea indica) database at GenBank.
Collections
- UT - Biology [2145]