Identifikasi dan Ekspresi Gen Parsial Penyandi Enzim D6-Desaturase-Like (D6D) pada Ikan Gurami Osphronemus goramy
View/ Open
Date
2020Author
Manalu, Erikson Aquino
Alimuddin
Carman, Odang
Metadata
Show full item recordAbstract
Asam lemak tak jenuh jamak (polyunsaturated fatty acid/PUFA) kelompok
omega-3 memiliki manfaat penting pada manusia, khususnya asam eikosapentanoat
(EPA; C20:5n–3) dan asam dokosaheksanoat (DHA; C22:6n–3). Omega–3 dapat
dibiosintesis dari asam lemak C18 oleh reaksi yang dikatalis oleh enzim desaturase.
D6-Desaturase (D6D) adalah enzim metabolik asam lemak yang bertanggung
jawab untuk langkah pertama desaturase dalam sintesis PUFA. Penelitian ini
bertujuan mengidentifikasi sekuen gen parsial dan menganalisis ekspresi gen
penyandi enzim D6-Desaturase-Like (D6D) pada ikan gurami Osphronemus
goramy yang diberi pakan berbeda. Panjang basa nukleotida yang diperoleh adalah
611 bp dan jumlah prediksi residu asam amino adalah 203. Sekuen D6-Desaturase
ikan gurami memiliki kesamaan (similarity) tinggi dengan ikan betok Anabas
testudineus, ikan gabus Channa striata, dan ikan kakap putih Lates calcarifer.
Analisis domain protein menunjukkan bahwa terdapat sekuen termasuk dalam
domain major facilitator superfamily (MFS) yaitu Delta-FADS-like, delta6-acyllipid
desaturase (PLN03199), desA superfamily, dan FA-desaturase. Hasil analisis
pohon filogenetik menunjukkan gen penyandi D6D ikan gurami berada satu
kelompok dengan ikan cupang Betta splendens dan ikan betok Anabas testudineus
dengan nilai boostrap 46%. Tingkat ekspresi gen D6-Desaturase-Like ikan gurami
lebih tinggi pada pakan daun sente dibandingkan pakan komersial setelah
pemberian pakan. Jenis pakan memengaruhi ekspresi gen D6-Desaturase-Like ikan
gurami.
Collections
- UT - Aquaculture [1988]