Karakterisasi secara Molekuler Bakteri Aeromonas hydrophila dari Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus) Asal Tiga Kabupaten di Provinsi Jambi

Abstract

Bakteri Aeromonas hydrophila merupakan salah satu agen penyebab penyakit Motile Aeromonas Septicemia (MAS) atau bercak merah yang sering menjadi kendala dalam budidaya ikan air tawar, salah satunya menginfeksi ikan lele. Infeksi bakteri ini dapat menurunkan kualitas daging dan menimbulkan kerugian ekonomi, dengan tingkat kematian 100%. Tujuan penelitian ini adalah untuk melakukan karakterisasi bakteri A. hydrophila pada ikan lele sistem kolam bioflok asal 3 Kabupaten di Provinsi Jambi secara seluler dan molekuler, serta mendeteksi keberadaan gen virulensi yang berperan dalam terjadinya kejadian penyakit Motile Aeromonas Septicemia (MAS). Oleh karena itu diharapkan dapat memberi informasi terkait keberadaan mikroorganisme A. hydrophila penyebab MAS serta dapat memberikan rekomendasi pemilihan vaksin yang digunakan sebagai pencegahan. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah ikan lele yang memiliki gejala MAS pada kolam bioflok asal Kabupaten Bungo, Merangin dan Muara Jambi yang diisolasi dari swab organ hati, ginjal, limpa dan usus pada media agar darah kemudian diidentifikasi berdasarkan Standar Nasional Indonesia (SNI 7303.1- 2015). Uji konfirmasi menggunakan metode PCR konvensional target gen 16S rRNA dan gen aerA, sampel positif gen aerA dilakukan sekuensing terhadap gen aerA. Deteksi molekuler gen virulen aerA dilakukan terhadap isolat A. hydropila menggunakan primer yang dirancang khusus untuk mendeteksi gen virulen aerA. Gen aerA merupakan gen virulensi aerolysin penyebab Motile Aeromonas Septicemia (MAS). Hasil penelitian menunjukkan bahwa penyebab Motile Aeromonas Septicemia (MAS) pada Ikan Lele Dumbo (Clarias gariepinus) di tiga Kabupaten di Provinsi Jambi Kabupaten (Bungo Merangin dan Muara Jambi) adalah bakteri A. hydrophila yang dapat di identifikasi secara seluler dan molekuler, serta ditemukan gen aerA.